把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
支付保函：是应业主（买方）申请，向施工方（卖方）提供保证担保，在施工方（卖方）按合同正常提供货物、相关服务或完成约定工程量后，如业主(买方)不按约定支付合同款项，则担保方接到施工方（卖方）索赔通知后代为支付相应款项。
办理银行保函的方式有两种
1、可以直接去银行办理，不过过程非常的繁杂，尤其是次还不一定能办下来。这个方式的缺点就是需要缴纳全额的保证金，比如想开一张100万的保函，那么就需要把这100万存到银行冻结起来，非常占用公司的资金。
2、通过担保公司把自己的授信额度授权给你来办理。需要办理银行保函的项目主要有施工类、采购供货类和服务类。这三类项目里也分很多种，比如施工的要看建筑企业资质，供货类的要看你是经销商还是生产厂家，服务类的就要看公司规模。每家担保公司所擅长的领域不一样，收费也就不一样。
银行保函业务是银行非常重要的表外融资业务，不占用银行的信贷资金，对资本占用较少，属于典型的中间业务收入。根据保函的种类我们可以用到投标保函、履约保函、预付款保函、农民工工资保函、关税保函等等多种类型。